海洋大學設有「基隆主校區」(祥豐校區、北寧校區、濱海校區)、「馬祖校區」與「桃園觀音校區」，交通便捷，濱臨海洋，山海校園，有獨特的龍崗生態園區與雨水公園等，且為通過認證的環境教育設施場所，還有優良圖書館、全興書苑、宏廣書屋、校史博物館、航海園區-自由中國號與海洋夢想基地等，校園幽雅，學術氛圍、生活機能與學習環境極優。本系系館位於本校祥豐校區，主要分為食品科學館與食品工程館，部分老師研究所室與實驗室位於海事大樓丙棟。

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